Uso de supercómputo para el descubrimiento de fármacos: un caso de estudio sobre CK1ε
DOI:
https://doi.org/10.22201/dgtic.26832968e.2026.17.129Palabras clave:
cáncer, cribado virtual, descubrimiento de fármacos asistido por computadora, reposición de fármacos, supercómputoResumen
La caseína cinasa 1 épsilon (CK1ε) es una enzima que promueve la progresión de diversos tumores, por lo que es considerada una diana terapéutica. Sin embargo, aún no existen fármacos con uso clínico contra CK1ε. En este estudio, utilizamos una estrategia de cribado virtual para identificar potenciales inhibidores de CK1ε. Utilizando recursos de supercómputo para realizar simulaciones de dinámica molecular, identificamos las interacciones que median la unión entre CK1ε e inhibidores reportados. Con estos datos, generamos un modelo de farmacóforo que empleamos para identificar candidatos dentro de grandes bases de compuestos. A continuación, realizamos acoplamientos moleculares seguidos de cálculos de propiedades ADMET y microespecies predominantes. Finalmente, usamos nuevamente recursos de supercómputo para caracterizar detalladamente el modo de unión de los compuestos más prometedores para inhibir a CK1ε, mediante simulaciones de dinámica molecular. Como resultado, identificamos tres compuestos con potencial actividad inhibitoria de CK1ε. Nuestros hallazgos ilustran cómo el proceso de cribado virtual, empleando modelos de farmacóforo y simulaciones de dinámica molecular realizadas con recursos de supercómputo permite identificar compuestos con potencial actividad inhibitoria sobre CK1ε. Además, discutimos el papel del supercómputo en la viabilidad de este tipo de estrategias, particularmente en estudios que requieren realizar simulaciones de dinámica molecular. La estrategia empleada en este trabajo aprovecha las capacidades de supercomputadoras para el descubrimiento de nuevos fármacos.
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